Sefactura, S.A. de C.V. nace como una un empresa del grupo Jonima, S.A. de C.V. que es una compañía privada 100% mexicana creada en 1980, enfocada al desarrollo de sistemas, servicios de mantenimiento y soporte, capacitación, investigación, consultoría, desarrollo de estrategias y diagnóstico para soluciones a la medida.

En el año 2006 se desarrolló la primera solución de facturación electrónica y en el 2010 se crea Sefactura como una empresa especializada en los servicios electrónicos de facturación.